Dessinez les molécules et cliquez sur l’un des boutons CHERCHER. Si vous avez besoin d’aide consultez la rubrique AIDE au bas de la page.
JME Editor courtesy of Peter Ertl, Novartis
Les éléments cis-, trans- et (R)-, (S)- ne peuvent être identifiés. Dessinez les molécules (R) et cliquez sur Rechercher afin de trouver les (R)-, (S)- et les racémiques.
AIDE
Icône
- Efface toute la zone de dessin
- Pour trouver un composé moléculaire constitué de plus de deux molécules comme les composé salins, les composés chélatés etc., dessinez une partie de molécule, cliquez sur le bouton NEW (NOUVEAU), puis dessinez une autre molécule. Nous vous conseillons d’utiliser le bouton Recherche par sous-structure.
- Passe en mode effacement (cliquer sur les atomes et les liens pour les effacer)
- Efface les groupes fonctionnels – sélectionner cette option puis cliquer sur la liaison qui relie le groupe au squelette principal.
- La charge électrique peut être modifiée avec le bouton +/-.
- Annuler la saisie précédente
- Les atomes "non organiques" ou les atomes avec une valence non standard peuvent être saisis à l’aide du bouton X qui permet de spécifier la chaîne atomique SMILES (sans crochets [], par ex. : Si, Fe++, NH3+)
Raccourcis clavier
- ESC
- Retour à l’état de validation standard (carbone, liaison simple)
Pour les fonctions ci-dessous, appuyez sur la touche correspondante de votre clavier et cliquez à l’endroit de la structure où vous souhaitez ajouter l’élément sélectionné.
- atomes
- C, N, O, P, S, F, I, H correspondent à chacune des désignations d’atome. L correspond à Cl et B à Br.
- liaisons
- - pour liaison simple, = pour liaison double
- cycles
- 3..9 pour cycles 3 à 9 chaînons, Ph : 1, furyl : 0
- groupes
- a : COOH, e : C≡C, ft : CF3, t : tert- butyle, y : NO2, z : SO2NH2
- Pour déplacer une molécule, cliquez près de l’objet en question et faite le glisser jusqu’à l’endroit où elle doit être placée.
- Pour faire pivoter une molécule, cliquez près de l’objet en question et tirez-le tout en maintenant la touche Shift enfoncée.
SMILES
SMILES signifie : Simplified Molecular Input Line Entry System. Il s’agit d’un système permettant de reconstituer des structures moléculaires dans du texte.
Si vous utilisez le logiciel ChemDraw, cliquez sur Edition / Sélectionner tout (Edit / Select All) pour sélectionner la molécule que vous dessinez puis cliquez sur Edition / Coller en tant que / SMILES ( Edit / Copy as / SMILES) pour la copier.
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